БИЭПП был основан в 1993 году Е.Д. Рейфе.

Создание института проходило при поддержке и содействии Международного независимого эколого-политологического университета (МНЭПУ, г. Москва) как Санкт-Петербургского филиала МНЭПУ. Формирование филиала было обусловлено необходимостью развития в России образовательных учреждений социально-экологической направленности, о чем свидетельствовало постановление Правительства РФ (№ 828 от 15.08.1993 и №1081 от 13.09.1996), поддержавшего деятельность МНЭПУ. В 1994 г. Филиал был преобразован в Балтийский институт Международного независимого эколого-политологического университета (БИ МНЭПУ), а в 1995 г. был переименован в Балтийский институт экологии, политики и права.

Учредители Балтийского института экологии, политики и права – Международный независимый эколого-политологический университет, а также физические лица. БИЭПП – член Ассоциации негосударственных вузов Санкт-Петербурга и Северо-Западного федерального округа.В составе института два филиала – в Мурманске и Челябинске. В структуре института входит Гуманитарный колледж, имеющий государственную аккредитацию, а также научно-методический и учебный центр информационных технологий, центр довузовской подготовки.

Деятельность БИЭПП направлена на постоянное развитие и совершенствование образовательного процесса. Наша работа и неуклонное стремление к совершенству, высококвалифицированный профессорско-преподавательский состав и эффективная административная база способствуют положительному рейтингу института среди студентов и высокому уровню трудоустройства выпускников. В планы института входит развитие комплекса дополнительных образовательных услуг, расширение спектра деловых международных связей, организация экспертной деятельности по профилю ведущих кафедр, работа по повышению квалификации специалистов и менеджеров ряда предприятий и организаций Санкт-Петербурга и области.